Al término del programa de doctorado los egresados serán capaces de formular de manera independiente proyectos de investigación con objetivos precisos; buscar, extraer, organizar y analizar datos históricos con técnicas, métodos y herramientas tradicionales o de última generación acordes con los objetivos de la investigación; interpretar y/o explicar procesos históricos determinados con argumentos y fundamentos sólidos; inscribirlos en contextos espaciales y temporales de distintas escalas, y generar, como resultado de todo lo anterior, nuevos conocimientos en el campo de la historia. De igual manera podrán analizar y evaluar críticamente la producción historiográfica contemporánea, inscribir su trabajo en el debate historiográfico actual y contribuir al desarrollo teórico y metodológico de la disciplina.
También estarán capacitados para transmitir los conocimientos adquiridos a través de publicaciones escritas y presentaciones orales dirigidas a públicos de distintos niveles, para aplicar sus conocimientos en la formación de nuevos profesionales mediante la docencia y la dirección de tesis, y para vincularse con la comunidad académica nacional e internacional así como con diversos sectores de la sociedad. Además estarán preparados para manejar los recursos de las tecnologías de la información y la comunicación, para concursar por fuentes de financiamiento, para ejercer la movilidad nacional e internacional y para comunicarse de manera fluida en dos lenguas extranjeras.
Tendrán asimismo una actitud ética, de buenas prácticas académicas, de respeto y reconocimiento explícito al trabajo realizado por otros investigadores y de compromiso con el trabajo de excelencia.